Hola metalfox, mira si no me equivoco para cambiar lo que vos necesitas y varias opciones mas tenes que ir al menu "options", ahi vas a "pcb properties y luego vas a la pestaña "Design rules". Y en la primera opcion que dice "Trace Width setting", ahi cambias el grosor de las pistas. Al hacer esto tene en cuenta que unidades usas mm, cm, `pulgada.
Estas opciones son para el pcb en general, supongo que se aplican al autoruteo. Pero no estoy seguro porque generalmente no uso el autorouting.
Suerte"!!!!