Con la regulacion, la situas antes del shunt, justo despues del puente rectificador.
Y con el shunt, mide el negativo, incluso con un arreglo de transistores bastaria para tu cometido.
Mira cómo leen la corriente de sobrecarga en fuentes reguladas, que usan el shunt desde el negativo y un par de transistores. Quizas invirtiendo o conectando de otra forma, puedes indicar con el LED, incluso puedes verificar rapidamente si una bateria no carga o incluso si esta mal conectada o desconectada.