Saludos jhx555, como antes habia mencionado para que trabaje el circuito completo (ambos lados juntos y conectados a la misma fuente) son necesarios 6V usando 4 baterias AA, la forma de conectarlos es indistinta, aunque recomiendo ampliamente hacer que ambas entradas de corriente en el circuito esten conectadas entre si, para que la alimentacion de ambos circuitos sea exactamente igual y en caso de variacion sea equivalente para ambos lados.
Como cada lado del circuito controla un motor y un sensor, es necesario que estos trabajen de igual, por lo tanto, el lado de la entrada positiva de un circuito, compartira la misma entrada positiva del lado contrario, asi como el negativo, de esta forma se estaria trabajando en paralelo para ambos circuitos y nos daria el resultado que esperamos, en si para contestar tu pregunta, cada lado funciona con 6 volts.