Los capacitores C9 y C10 están para acortar el tiempo de apagado (OFF) de los transistores de potencia Q1 y Q2, o sea están para aplicar una fuerte polarización inversa al momento del apagado para acelerar el drenaje de los portadores mayoritarios que se acumularon durante la saturación (o sobresaturación). Ahora ¿porque se calientan demasiado? sospecho que puede haber una sobresaturación de Q1 y Q2 lo que genera una corriente de descarga grande a través de C9 y C10.
Propongo revisar el circuito de encendido de Q1 y Q2, osea D3, R7, R6 y D4, R11, R10, verificar que los valores de las Resist. sean los adecuados y que los diodos sean ultrarrápidos, y algo más: los capacitores recalentados deberían ser de bajo ESR en lo posible; una última cosa: se podría probar (dentro de márgenes razonables) achicar R7 y agrandar en la misma magnitud R6, esto ralentizaría un poco (poquito) el apagado y en teoría debería enfriar los capacitores. (por supuesto que alargar el tiempo de apagado se traduce en mayores pérdidas en los transistores de potencia), en fin, solo algunas ideas que espero que te sirvan.
Saludos