Hola:
Muchos de los integrados en Proteus tienen los pines de alimentación ocultos, el programa alimenta los integrados automáticamente es por eso que no se ven.
el 74HC139 realmente tiene 16 pines, no es que en proteus tenga solo 7, es un demultiplexor doble, es decir el integrado tiene 2, si colocas uno de ellos aparece como U1:A significa que es el demux 1, so colocas otro aparece como U1:B es el segundo del mismo integrado.
Si vas a las propiedades del integrado en Proteus veras un botón que dice HIDDEN PINS, si lo presionas veras el nombre de los pines ocultos de alimentación, y es ahí donde los conectará dentro de tu circuito, el pin GND va a tierra y el otro se llama Vcc.
De esta forma al crear el PCB los conectará de forma automática sin necesidad de que lo hagas en ISIS ni tener que verlos.
Espero que esto resuelva tu duda si no dime y te ayudo un poco más...