Las placas perforadas, sirven para salir del paso y no tener que hacer un PCB. Muchas veces es una solucion efectiva, otras no. Las placas vienen ya perforadas, por lo que las pistas, es decir, las lineas de cobre, o islas, segun el impreso, deberan ser unidas acorde al circuito de interconexion que uno quiera realizar. Con respecto a si es lo mismo, para el caso que planteas no hay problemas, mientras respetes el conexionado podes usar cualquier pista de la plaqueta perforada.
Saludos.