Pues son basicamente lo mismo, es que a la gente le gusta cambiar palabras
Cpu es la unidad que procesa todo, ahora esta encapuslada en un chip de silicio , es cierto que se puede construir una CPU a compuertas logicas en un protoboard y sería enorme.
Pero a la gente le gusta llamar CPU al gabinete entero de una PC aunque en realidad el CPU es el chip de silicio que normalmente es un AMD o un Intel.
Es como al jitomate la gente le cambio el nombre a tomate haganme el favor.