Es completamente lógico que deforme un poco la señal, pero le estas escapando a la solución...me parece. Lo primero que nos tenés que decir es el ancho de banda de la señal cardíaca del conejo, así que tomá la señal cardíaca y aplicale una FFT para ver cual es el armónico mas alto que tiene. En segundo lugar, analizá hasta donde necesitas todo el ancho de banda de la señal...y de ahí recién podemos seguir hablando.
Te digo esto por que parece que solo querés eliminar los 60-Hz, pero si la fundamental es de 5-Hz, tal vez no sea necesario un notch, sino un pasa-bajos, y en ese es mas fácil de controlar la fase. Y si nó, tendrás que usar un FIR...y un DSP.