Pues en ese circuito, con el potenciometro ajustas el VRef segun el comportamiento del motor, si ves que con determinada carga, se empieza a calentar ahi fijas el Potenciometro y deberia de calentar menos.
y por ultimo con lo del timer, primero dale una buscada debe haber muchos proyectos, y solo repetiria lo mismo..
el circuito parece estar bien diseñado asi que armalo y empieza a experimentar.. y si tienes dudas concretas haces la pregunta.