Esa opción de la que hablais se activa pulsando la tecla 3 en el espacio de trabajo del PCB, o también desde el menú View -> Switch to 3D.
Pero atención, en mi ordenador no tengo problemas para ver esto, porque tengo una tarjeta gráfica 8800, en cambio en el ordenador del trabajo con una tarjeta gráfica más modesta, el 3D no va, y creo que es por esto que no te va. Prueba a instalarlo en otro PC más potente a ver que tal y nos comentas.
Chao.
PD. En los tutoriales de la web de Altium, te explican todos estos detalles.