Tienes que utilizar 3 pilas, si tu empleases 4 pilas tendrias 6v, los cuales despues de pasarlos por el diodo obtendras 5,3V. La tarjeta no se dañara por aplicar esa tension, pero el problema es otro:
Como la tarjeta esta continuamente alimentada por las pilas a 5,3v, en el momento que tu la conectes en su modulo correspondiente, este le aplicara 5V. Los 0,3V que tu estas aplicando de mas estraran en dicho modulo y como yo no conozco el esquema del modulo, cabe la posibilidad de que este salga dañado, o bien te cortocircuite los 0,3v, con lo que te decargaria las baterias o incluso podria destruirte el diodo rectificador.
Lo mismo no hay ningun problema, pero yo prefiero curarme en salud.