Cuando imprimis el pcb para transferirlo a la placa de cobre tienes que hacer que se vean los agujeritos, es decir que al atacar el cobre queden los agujeritos marcados. Esto no solo te dice donde perforar sino que te deja un pequeño relieve que evita que la perforadora "camine" y te corra el agujero.
Si lo haces asi lo del clavo es innecesario, y te ahorras el estar martillando la placa que es una muy mala costumbre, ya que el polimero es muy rigido y se astilla por dentro.
Para uqe la mecha no se doble, con hacer la fuerza necesaria y no mas, y usar mechas afiladas a las revoluciones adecuadas (no mas de 900) no vas a tener probelmas.
Saludos.