alguien sabe si esos sensores se consiguen aca ??
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Hice esa misma pregunta y me contestaron
acá -> Elko/Arrow
Yendo al tema de la pregunta, si el transformador no está bien blindado y la corriente medida en la pista de interés es pequeña en comparación con lo que maneja el trafo, podría ser un problema.
Como dicen arriba, la prueba a realizar seria poner un blindaje entre el trafo y el sensor (puede ser un pedazo de chapa de una fuente AT vieja por ejemplo, no de aluminio que no es ferromagnético!!!, hay que ver que hay en el baúl con el certificado de defunción ya puesto

).
El sensor mide campo magnético, en teoría cualquier cosa ferromagnética cerca distorsiona el campo a medir concentrando las líneas de flujo, pero como el sensor se conecta en serie con la pista a medir y está tan cerca, creería que no debería verse muy afectado por el transformador con blindaje.
También puede influir el diseño de la placa. Si la pista a medir está muy cerca (unos pocos mils) de otra pista por la que circula una corriente importante, ésta también genera un campo magnético que puede sumarse al campo que queremos medir.
Otra cuestión importante: no poner la pista de masa muy cerca de la pista a medir. Si bien normalmente es recomendable tener un plano de masa donde la corriente de retorno pueda seguir un camino paralelo a la pista (1 capa)/debajo de la pista (2 o más capas con 1 capa haciendo de plano de masa), para esta aplicación puede ser necesario violar esa práctica para que la corriente de retorno no anule el campo de la "corriente de ida" -> es lo mismo que una pinza amperométrica: si medís en 1 solo cable la lectura está bien, si medís el cable con el neutro no medís nada.
Última: siempre que no pase lo anterior, si efectivamente hay problemas con el campo del transformador sumándose al campo de la pista a medir; se podría filtrar a ver que pasa. El transformador trabaja a 50 Hz + armónicos, y la corriente del cargador de batería es continua.
Se podría intentar meter un filtro (pasabajo, notch...) o si estás con el Arduino aprovechar el ADC para tomar varias muestras y promediar (quizás con eso alcanza).